Comarch PPK pozwala na współpracę z każdą z instytucji finansowych obsługujących Pracownicze Plany Kapitałowe. Ponadto z niektórymi instytucjami finansowymi aplikacja umożliwia w pełni automatyczną wymianę danych. W najnowszej wersji aplikacji usprawniono pobieranie informacji o zwrotach środków w sytuacji uruchomionej automatycznej wymiany danych z instytucjami finansowymi.