Błąd „duplikacji zapisu” w KSeF potrafi zablokować wystawienie lub wysyłkę dokumentu z Comarch ERP i w praktyce zatrzymać proces fakturowania. W wielu przypadkach problem nie wynika z samego KSeF, tylko z tego, że operator nie ma włączonych odpowiednich uprawnień do edycji danych na dokumencie.
Najprostszy sposób obejścia (gdy sytuacja tego wymaga) to włączenie parametru, który pozwala oznaczyć dokument jako wystawiony „Poza systemem” i ręcznie uzupełnić dane dotyczące KSeF na zatwierdzonym dokumencie.